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OmicsBean  Venn筛选功能升级更新,数据分组无限制

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   OmicsBean系统Venn功能升级更新,切实解决实验数据超过5组的情况。Venn功能升级更新后,无论实验数据有多少分组都可以通过Venn进行筛选。

Venn筛选在OmicsBean数据分析系统中用于构建研究模型,对于多组,多时间点的差异数据可以直接通过Venn进行模型构建,对于多组带重复的实验矩阵数据要经过差异筛选后对得到的差异数据构进行模型构建。以下是4组与6组实验数据的Venn筛选模型示例图。

 

1  拟南芥四组差异蛋白数据的Venn筛选模型图


  图1 Venn图中每个颜色对应的环代表每个分组的实验数据,环中的数字表示该分组中特有的蛋白或基因个数。多个环相交的部分代表多个分组数据的交集,相交环中的数字表示多个分组数据共有的蛋白个数或基因个数,括号中的数字表示多个分组交集数据中相互存在差异的蛋白个数或基因个数,默认差异倍数为2Venn图中可以点击各个分组进行合并分析,分组被选择后颜色会变为红色。

     图2  拟南芥六组差异蛋白数据的Venn筛选模型图


  图2 Venn图中蓝色小方格表示左侧每个分组特有的实验数据,对应的右侧的数字表示该分组特有的的蛋白个数或基因个数。每行超过两个小方格表示多个分组实验数据的交集,相应的右侧对应的数字表示多个分组共有的蛋白个数和基因个数,括号中的数字表示多个分组交集数据中相互存在差异的蛋白个数或基因个数,默认差异倍数为2。在Venn图中可以点击各个分组进行合并分析,分组被选择后颜色会变为红色。


    OmicsBeanVenn筛选可以快速分析蛋白或基因在不同分组中的表达变化情况,建立研究模型。通过Venn合并分析可以建立PPI模型,快速分析与研究方向相关的重要生物通路上的关键基因在不同的分组中的变化情况。