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如何对蛋白序列做功能分析
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之前本人写过一个贴子讲的是 如何知晓一列基因/蛋白的功能和相互作用关系,这种情况适用于已经知晓基因蛋白名字的情况,但若我们只有相应的蛋白序列,此时我们就要经过blast转换一下,ncbi等工具都可以轻松做到,但在omicbean中也可以直接上传序列文件,blast之后对这些蛋白进行功能分析。下面我要讲的就是详细的步骤。


首先要将序列文件格式整理成如下图的样式




然后将此文件上传至omicsbean,注意第三步将id类型选为Fasta Sequence。



上传之后系统blast之后,自动做功能分析(暂选了三个蛋白作为演示,故模型图中蛋白点较少)。