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手术麻醉损伤记忆力的分子机制研究

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麻醉会影响记忆力?答案是肯定的。

在协助南方科技大学的一个课题项目进行分析的过程中,我们通过比较使用异丙酚进行麻醉的老鼠的表达芯片数据,获取了异丙酚作用下,脑海马区的差异表达基因列表,并进行了生物功能富集分析,结果发现,这些基因主要是和神经突触的塑化过程有关,也参与包括大脑皮层发育,学习记忆以及行为形成相关的过程。进一步通过PAS算法,发现这些功能均在麻醉刺激下被抑制,进而造成对记忆力的损伤。


客户进而希望知道这些基因是被哪些miRNA调控的,可以进行实验验证,从下列显著相关的生物过程中,我们和客户一起选取了4项进行后续分析

四项分析.png


通过omicsbean(www.omicsbean.cn) ‘基因找miRNA’功能,我们帮助客户对其关注的7个基因在miRbase v21, mirTarbase, miRanda 2010, miRbase v18, Tarbase5.0, targetscan v6.28个数据库中计算靶miRNA,并进行筛选:

a) 同时在2个以上数据库中存在互作

b) 异丙酚文献中未报道过的

c) 优先选择同时是两个以上基因共同的靶miRNA

d) 在人中存在同源的

结果,在所有备选986miRNA中,我们最终成功帮助用户筛选到一个同时符合4项需求的miRNA

整个课题项目的分析思路如下所示:

分析思路.png

GEO数据库通过移手术检索,到找到麻醉影响人体的中枢神经系统,行为意识以及大脑的发育,同样的思路和方法可以挖出更多的课题项目。如对分析有疑问可以关注下面微信号咨询

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金弗康科研团队专注生物信息分析科研外包服务,自主研发的omicsbean 生物云平台上线近两年时间,已经有30多家高校和研究所使用该软件平台发表SCI文章,总影响因子达到124.147,其中最高影响因子26.9,包括多篇发表在Nature,Science等杂志的文章。

金弗康生物科技致力于大数据产业自动化和智能化解决方案,是上海市科创板挂牌企业(300151),高新技术企业以及大数据专项建设承担企业,依托自主研发的基因检测工业化系统,整合上下游优质基因检测和健康干预管理产品,成为国内基因检测和精准医疗配套服务商。公司专利储备56个,其中发明专利42个,软件著作权专利14个。

目前覆盖病理检测,医学普检,癌症检测,遗传病检测的智能化基因检测系统进入市场后,多家医院,医学检验机构都购买和租用系统来提高生产效率,实现检测数据精准解读。

公司未来发展方向定位在大数据技术将遗传病检测服务拓展到开发检测试剂盒,癌症早筛(ctDNA检测)通过分子标签技术实现精准检测,临检、病理、特检相结合的区域一体化检测中心实现云端化数据传输,靶向中药用于临床癌症治疗等方面




文章分类: 精选案例