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Venn分析高级教程

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Venn分析是展示多组数据特异点和共同点的主要方法,上传文件格式和绘制方法上一期的入门课程《Nature 文章如何用venn来分析数据 中已经讲解过。这期主要讲解使用venn分析绘制种不同组数的venn图,如何合并不组特异蛋白,如何查看特异蛋白和合并后蛋白的功能。


原始数据为6差异蛋白列表,IDUniprotID,物种为拟南芥,实验设计为:植物干旱胁迫124816天,32样本。数据格式在上一期讲过不同时间点蛋白差异列表上传omicsbean软件www.omicsbean.cn免费账号密码:omicsbean 进行不同组数venn分析

两个组进行venn分析,图括号中的数字表示,两组的数据差异倍数大于cutoff参数设置值(venn app可以设置,默认为2

干旱胁迫1d,2d4d进行venn分析,图中可以看到2d特异蛋白74d组特异蛋白63

4组进行venn分析查找不同时间点的特异蛋白,图中显示9蛋白为共有的蛋白。

5组进行venn分析,从图中可以查看不组的特异蛋白,和两组之间共有的蛋白,及共有蛋白中的差异蛋白。

6组进行venn分析,得到了横版的表格式的venn,右侧会显示venn 的蛋白个数和属于差异的个数。

每个venn中都有特异的蛋白,如果想把这些蛋白合并怎么办,这些特异的蛋白和合并后的蛋白分别有什么功能怎么看?接下来我们进行venn分析高级功能展示。

从多venn分析,到合并特异蛋白合并后的蛋白功能富集分析,特异蛋白的功能富集分析都可以在这个venn app上点点轻松实现

只需要一步,venn图分析就完成了,想获得更多绘图技能的小伙伴快加我微信,邀请您加入omicsbean数据分析绘图交流群,我们在那等您。